Das „Prison Break Theme“ (die originale Titelmelodie der Serie) wurde von Ramin Djawadi komponiert, der dafür eine Nominierung für den Emmy erhielt. Der belgische Sänger Kaye Styles sang auf Anfrage des US-Fernsehsenders Fox den Rap-Song „Prison Break Anthem“, der auch als Titelsong für die Ausstrahlung der Serie auf dem belgischen Fernsehsender KanaalTwee diente. Er erschien als Single und als Musikvideo. Eigens für die französische Ausstrahlung auf dem französischen Fernsehsender M6 dient das von dem aus Marseille stammenden Rapper Faf Larage gerappte Lied Pas le temps als Titelmelodie zur Serie. Er erschien ebenfalls als Single und als Musikvideo.

Auch RTL gab einen Titelsong in Auftrag: Das Lied mit dem Namen „Ich glaub' an Dich - Prison Break Anthem“ übernimmt die Musik von Faf Larage und wird von Deutschrapper Azad und Adel Tawil (Leadsänger der Gruppe Ich + Ich) performt. Das Lied ist im Trailer zu hören. Ein passendes Musikvideo zu Ich glaub' an Dich - Prison Break Anthem wurde ebenfalls gedreht.

Am 17. August 2007 belegte der Titelsong den ersten Platz der Deutschen Single-Charts.